Änderungen

Ok, so jetzt befriedigen wir unsere Neugier.

Als erstes benötigen wir paar Software

Erstmal benötigten wir Software (alles Freie Software)

SnapGene

https://www.snapgene.com/snapgene-viewer/

Mit dieser Software kann man sich Gen Sequenzen anschauen, genauer DNA Sequenz. Basierend der Sequenzen wird auch die Enzyme angezeigt.

Freie Cloud Server Dienst um aus Enzym Sequenz ein Protein zu berechnen. Je nach Komplexität kann es mehrer Stunden dauern

http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index

Software um Moleküle zu visualisieren.

https://sourceforge.net/projects/jmol/

Als letztes brauche wir das complete Genom unser Virus

Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_045512?fbclid=IwAR0QIfHRx9ktGU6VojsdWvWtRitUCYQSCtD7xsWtqGusS55xVDzw0uigWLs

Von hier benötigen wir die "accession" ID. Mit diesen ID kann man sich die Sequenz aus einer Repository später in SnapGene runterladen.

Für unser Virus ist es die accession ID -> NC_045512

[[Datei:corona_accession.jpg|500px]]

Step-by-Step Anleitung wie man in SnapGene ein Genom lädt

Wie oben beschrieben besorgen wir uns erstmal die accession ID (NC_045512). Mit der accession ID könne wir es importieren Files -> Import ->NCBI Sequenz .