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COVID-19 Nukleotidsequenz anschauen

629 Byte hinzugefügt, 09:22, 7. Mär. 2020
Vorwort
Erstmal, Ich bin kein Biologe, nur ein neugieriger Bastler ;D
Folgende Anleitung basiert aus einen Facebook Video, hochgeladen von einen BioClub Tokyo BioHacker(JiKong Chan).
https://www.facebook.com/groups/BioClubPublic/permalink/2909493445774566/
Für unser Virus ist es die accession ID -> NC_045512
[[Datei:corona_accession.jpg|500px]]
Step-by-Step Anleitung wie man in SnapGene ein Genom lädt
Wie oben beschrieben besorgen wir uns erstmal die accession ID (NC_045512). Mit der accession ID könne wir es importieren Files -> Import ->NCBI Sequenz .
[[Datei:snapgene_import.jpg|500px]]
Wenn wir erfolgreich importiert haben müsste es ungefähr so aussehen.
[[Datei:snapgene_import_done.jpg|500px]]
Wir ändern die Ansicht damit es übersichtlicher ist.
[[Datei:snapgene_view_rund.jpg|500px]]
Super vereinfachtes Teardown des Virus.
 
[[Datei:corona_teardown.png|500px]]
 
Was wir mit SnapGene betrachten ist die RNA. Da der RNA quasi eine Bauanleitung des Virus ist, kann man auch die einzelne Bauanleitungen der Komponenten in der RNA finden. In den oberen Bild habe Ich die Kürzel der Komponenten im Klammer gesetzt. Beispiel "S" für den Spike. In SnapGene ist es auch mit S gekenzeichnet. Der Spike ist die Komponente was den Virus befähigt seine RNA ins Wirtszellen einzuschleusen.
 
[[Datei:snapgene_select_spike.jpg|500px]]
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